施琅率领大型战船三百余艘、水兵四万余人、五百余艘中小战船，从福建东山岛扬帆启程，进逼澎湖。
二天后，施琅攻取了澎湖港外的虎井、桶盘二岛，扫清了外围。
四天之后，施琅亲率六十只大型战船组成的主攻部队，正面进攻郑军主阵地娘妈宫;登莱水师提督王行率领由五十只战船组成东线攻击部队，从澎湖港口东侧突入鸡笼屿，作为奇兵，配合主攻部队夹击娘妈宫;松江姚一耀率领七十只战船组成的西线攻击部队，从港口西侧进入牛心湾，进行佯攻登陆，牵制西面的郑军。此外，剩余战船作为预备队，随主攻部队跟进。
郑家和施琅都知道这是决定命运的一战，于是一交手便展开了厮杀，激战历时七昼夜。
南海波浪滔天，炮声不断，血流染红了这片海面。
施琅巧妙利用有利的西南风向条件，采取“五点梅花阵”战术，即用多艘战船围攻郑军一艘，集中兵力作战。顿时，茫茫大海上朵朵“梅花”飞舞，大明水师越战越勇，一举攻克澎湖列岛，击毁郑军大小战船近两百艘，歼灭其精锐。
郑芝龙侥幸依靠熟悉的地形带少数部下逃回东番岛。
消息传到金陵，侯玄演欣喜若狂，在王府设席大宴群臣。
第408章 血统最纯正的海贼
水师五年的蛰伏，终于换来了对郑家的大胜，没有人比侯玄演更了解这其中的曲折。
普通百姓只知道水师一出手，郑家不堪一击，浑然不曾想过朝廷这么多年的隐忍退让、积蓄力量。
郑氏一族被赶到了东番岛，他们的水师主力虽被击溃，但是几个首脑尚存。若不及时占领东番，彻底剿除这些人，早晚还会死灰复燃。
侯玄演提笔写了两句诗，送给施琅和三家水师：
宜将剩勇追穷寇，不可沽名学霸王。
施琅自然没有多余的妇人之仁，事实上郑成功现在还没有杀他全家，他对郑氏没有仇恨，但是施琅深知，郑家对自己的仇恨比天还高。
当初福州还有机会守住，郑芝龙回师之后，守住区区福建不成问题。可惜他所托非人，被施琅开城投降，郑家彻底失去了和侯玄演抗衡的力量。
三家水师浩浩荡荡，从澎湖开往东番岛，施琅考虑到东番岛是一座巨岛，岛上遍布高山，若是郑家铁了心负隅顽抗，很难彻底平定岛上的残余力量。