随后，曾国藩又指挥湘军进行过几次突袭，都被联军击退，除了密集地子弹，迎接湘军近距离突袭的还有使用黄色炸药，威力巨大地地雷、不下于普通土炮的手雷和“九幽之火”燃烧瓶。
数次突击失利，抛下近千具尸体以后，曾国藩认识到关进入福建已不可能，于是改变策略，只是扎紧营寨不让太平军冲进江西。
十一月下旬，曾国藩得知闽浙总督庆端身亡，闽西战事烂，立即上表奏称石达开部与洋人勾结，其拥有的枪炮之利，世所罕见。
在兵策上，他完全放弃入闽作战的计划，他现在担心的，反而是石达开冲出福建，进攻江西。
石达开分兵严守关隘的同时，纵兵横扫闽南，在占领邵武、延平两府以后，又南下汀州、龙岩、泉州，一路所向披靡，攻城略地。
而在东线，叶枫的新军却一路向北，相继收复宁德、福安、霞浦和福鼎，收服福宁府全境，并配合曾国藩奏称太平军兵器之利，战事困难，以福建一省之力，恐难抵挡，唯有肆死守卫。
对于清廷来说，福建呈现出来的乱象让他们大为惶急，在曾国藩顿兵不前，庆端兵败身亡，叶枫收服失地三者面前，咸丰皇帝一面嘉奖叶枫，要其统领福建之兵，与长毛作战；又申斥曾国藩，要其迅速救援福建，并升浙江巡抚胡兴仁为闽浙总督，统浙军救援福建。
事实上，浙江绿营在石达开面前连守土都做不到，更遑论支持福建战场。
在咸丰八年，公元一八五八年最后两个月，福建战场已成为叶枫与石达开的二人转，旧的政权和绿营在石达开的太平军面前纷纷瓦解，被不断清洗，叶枫的新军随后则摆出架势，次第收复沿海的田、泉州、厦门、漳州等地，各领东西，形成“对峙”，然后屯兵养民，开始根据地建设。
根据“叶石协定”，太平军横扫闽南时，已经将旧式政权破坏干净，战后虽然重建，大权却掌握在叶枫手中。
叶枫暂时没有充足的资源对地方机构进行彻底整合，只是削弱他们的权利，只保留最基本的职能，需要恢复的恢复，不需要的就趁机裁撤，一切以战事需要为原则。
叶枫主抓的还是工业生产，随着太平洋电缆的连接，叶枫可以保持对欧美产业和研究所的控制和影响，在过去的一年多时间中，诺贝尔财团发展最快的是钢铁、染料、炸药和煤油产业，也正是这三大产业，为诺贝尔家族，也为叶枫本人带来了大量的财富。
电气和通讯发展得也非常快，随着大西洋、太平洋电缆的铺设成功，由英国人投资，起于英国、经过法国，然后跨过非洲通过印度的亚欧电报线也已经开工过半，最乐观的报纸已经发出“地球村”的感慨，他们认为，电报线将使欧洲、美洲、亚洲连接在一起，对于列强来说，通讯的进步将大大加强他们对于殖民地的控制和掠夺。