尽管作了种种努力，美军仍然未能夺回莱特岛的制空权。“神风”特攻机对第3和第7舰队的舰只频繁进行撞击。哈尔西舰队有6艘巡洋舰被撞伤，金凯德舰队有2艘战列舰、2艘巡洋舰，2艘登陆兵运输舰和7艘驱逐舰被撞伤。其中“艾布纳·里德”号驱逐舰被撞沉。在“神风”特攻机11月25日对第38特混舰队进行一次特别猛烈的突击后，第3舰队曾一度停止了在菲律宾海域的作战活动，这支舰队几乎在海上连续奋战了三个月。
日军不顾损失惨重，到11月中旬已在莱特岛集结部队约70,000人，与已经登上该岛的约100,000名美军相对抗。美军的鱼雷艇队负责阻止日军进行增援，有时迂回到莱特岛的西侧，去袭击日军的舰船，击沉日军输送部队的船只多艘，货船2艘、小型运输船2艘和巡逻艇2艘。第3舰队撤离后，金凯德命令扫雷艇队清扫莱特岛与保和岛之间的水道。后来，又数次派出驱逐舰专门进行夜间扫雷，以清扫乌目港附近水域的水雷。首次派去扫雷的驱逐舰在这一水域击沉一艘处于水面状态的潜艇；第二次派去扫雷的驱逐舰击沉一艘小型货船；第三次前去扫雷的驱逐舰袭击了日军开往乌目港的一支护航运输队，但也遭到日军飞机和2艘驱逐舰的猛烈反击。美驱逐舰击沉日驱逐舰一艘，可是另一艘日驱逐舰实施鱼雷攻击，有一条鱼雷击中“库柏”号驱逐舰，把该舰炸成两段，随即沉入大海。
截至12月1日，日军的死亡人数已大大超过它的增援兵力，而登上莱特岛的美军部队实际上已达183,000人。然而，美军只能使用一些泥泞难行的道路进行补给，战斗行动进展缓慢。此后，美军的骑兵第1师从北而南穿过群山连绵的地区，向乌目港疾驰。美军的步兵第7师则沿海岸从南向北推进，直指乌目港。为了加速进攻乌目港的进程，第6集团军司令沃尔特·克鲁格中将决定，在乌目港北线日军(正与骑兵第1师交战)和南线日军(正与步兵第7师交战)之间派兵从海上登陆，以便分割敌人，予以各个歼灭。12月6日，第77师的两个团战斗队搭乘登陆舟艇和驱逐舰，在第7舰队12艘驱逐舰的护航下，迂回到莱特岛西侧，7日晨，在乌目港以南3海里处开始登陆。
日军的守备部队企图阻止从南北两个方向同时发起进攻的美军，但因乌目地区的一大部分兵力已被调走，登陆的美军实际上未遭到任何抵抗。直到登陆兵安然上岸后日军才开始进行反击。然而，当时尚停留在登陆地域附近的海军部队，却遭到“神风”特攻机的猛烈突击，日机数量远远超过了担任空中掩护的美机数量；“神风”特攻机的撞击，使“马汉”号驱逐舰和“沃德”号运输驱逐舰受到重创，不久即沉没。数日后，“神风”特攻机又对盟军驶向这一登陆地域的护航运输队进行突击，击沉“里德”号驱逐舰，重创“考德威尔”号驱逐舰。“神风”特攻机飞行员的战术已有明显改进，这项示着盟军对日军的海上作战尚有艰险。