此时韩侂胄正准备北伐，吴曦的立场对金国和南宋都十分关键。南宋朝廷浑然不知金章宗离间之事，还任命吴曦兼任四川宣抚副使。本来，这应该足以让吴曦与南宋关系更近一层，不料在这个关键时候，四川宣抚使程松与吴曦发生了巨大矛盾。程松之前为钱塘县令，因巴结韩侂胄而一飞冲天，在四年内就由知县升到宣抚使的位置。他作为韩侂胄的心腹被派到四川，隐有监视吴曦的使命。但其人才干平庸，不足以服众，甚至还拿出了长官的架子压制吴曦，促使吴曦快速倒向金人的怀抱。他先是利用吴氏在四川的根基架空了程松，并派亲信姚淮源前去与金人接触，提出愿意献出阶、成、和、凤四州给金人，换取金人封他作“蜀王”。
金人当即答应，命吴曦只需按兵不动即可。
吴曦叛变后，金军便无西顾之忧，全部部署东线战场。结果，宋军在东线接连战败。南宋权臣韩侂胄因出兵无功，罢免指挥军事的苏师旦和邓友龙，用丘崈为两淮宣抚使。丘崈一到任，便采取守势，结果，又连遭失败。丘崈便干脆与金军秘密谈和。东、西两线都按兵不动，韩侂胄立即处于孤立。金人随即兵分九路，大举南下，开始了全面反攻，战线波及整个宋金边界。宋朝连连败退，形势颇为不利，南宋朝廷大震，议和的呼声又一次高涨。韩侂胄见宋军接连在军事上失利，罢免了丘崈，改命张岩督视江淮兵马，同时，又派使臣方信孺到开封向金人请和。
其时，金军由于战线过长，损失惨重，已经无力再战，却趁机对南宋朝廷开出了高昂的议和条件：割两淮、增岁币、赔军银，以及北伐首谋者韩侂胄的人头。韩侂胄大怒，决意再度整兵出战，并决定再度起用名士辛弃疾，任命他为枢密都承旨。但此时辛弃疾已经卧病在床，未及受命，便与世长辞了。临死还挥臂高呼“杀贼”数声。这个以武起事、以文耀史的伟岸男子，最终壮志未酬，空留下一腔浩叹。
吴曦叛宋降金是南宋中期的重大事件，不仅令西线宋军元气大伤，也对南宋后期局势造成了重大影响。最直接的后果就是促使了“以文制武”体制的恢复，南宋朝廷逐步加强制置使、宣抚使的统兵权力，多由文官担任，剥夺了各屯驻大军都统制的指挥权，“暗帅”“暗探”等新鲜事物应运而生。
不仅如此，吴曦一事还引发了南宋中枢的急剧动荡。军事上的失利和吴曦叛宋成为朝野上下攻击执政大臣韩侂胄的主要理由，他本人威信大大下降。韩侂胄的政敌史弥远和宋宁宗皇后杨氏便想借机铲除他，一场政变在朝廷内发生了。
史弥远率先上书弹劾韩侂胄，指责开禧北伐以来百姓死伤无数，公私物力非常困难，给国家造成祸害。杨皇后也趁机让皇子赵曮在宋宁宗面前指责韩侂胄，说韩侂胄再启兵端，将危害国家。但宋宁宗依然信任韩侂胄，于是杨皇后决定铤而走险，召兄长杨次山入宫，命他与史弥远商议，诛灭韩侂胄。开禧三年(1207年)十一月初三，史弥远在杨皇后的支持下，矫称有密旨，令权主管殿前司公事夏震率兵三百，埋伏在六部桥侧，等韩侂胄入朝时，将其截至玉津园夹墙内活活打死。