接着，他们再次创造生命，运用第二次的生命为蓝本。创造出了第三种智慧种族。两者并没有什么太大的差别。
结果，这一次，那种奇怪的现象再次出现了。这个种族中，再次出现了一个强大的个体。于是，他们再次抓住了这个强大的个体，进行研究。
结果不用说了，他们依然没有什么可喜的发现。无论是对比，还是单个研究。都没有任何的结果。
于是，他们再一次毁灭了这个文明，这个刚刚开始发展的文明。
后来。第四次的智慧生命，又被他们创造了出来。这一次被创造出来的人类，就是亚特兰蒂斯文明。
同时，生命设计师一族出现了危机。在他们中间。莫名出现了一个叛徒。这个叛徒，发现了这些突然变化的强大的个体的秘密。他被一个莫名的存在告知，宇宙是来自模拟。而他们，自诩为生命设计师，只不过是一个大大的笑话。
所以，他发誓。他要弄清楚这一切，到底是怎么一回事。这个模拟宇宙到底有着什么样的目的。
要做到这一切，他必须要成为他们这一族的首领，拥有他们所有的资源。于是，战争再一次爆发了。这一次的战争，从银河系一直达到银河系外。
最终，这个叛徒取得了决定性的胜利，那些不服从他的人，彻底遭到了绝杀!
可是，当他们最终抢回哪两个发生了奇怪的变化的强大个体的时候，这两个个体，又发生了奇怪的变化!几乎长年累月的研究，他发现，这两个个体体内，无论是基因，还是灵魂，都变回了当初他们设计的模样。
而他，从这两个个体的眼睛中，发现了一点蛛丝马迹。哪里的细胞，有着不太明显的改造痕迹。
于是，他们再一次来到了地球。
这一次，地球上，亚特兰蒂斯文明，利用那场战斗中，跌落地球的残骸，整个文明进入了高速发展时期，等他来到地球的时候，亚特兰蒂斯文明，依然成为了地球的中心。
而他，更是在人类当中，发现了无数发生变化的个体，这些个体，拥有着远超常人的力量。更有两个人的力量，强大到就连他，都胆战心惊的地步。
这是怎么回事?
为了让地球上的亚特兰蒂斯文明，不至于影响到自己一族，他悍然发动了对地球的攻击。
这一场战斗，旷日持久。持续了上百年。
最终，亚特兰蒂斯文明因为底蕴不足，被生命设计师一族，给逼进了中心城市。同时，身为这个宇宙的观察者，同样被这个生命设计师的叛徒发现。成功抓住了他。
在那个莫名声音的带领下，他成功消灭了亚特兰蒂斯文明，并且获得了最重要的一样东西，能够证明宇宙来自模拟的重要证据。