公元2093年本已脱离战争的萧家，在月球宣布其将重新投入战斗。2094年“毁灭者X”、“雷神”、”终结者”……等六台巨型武器先后建设完毕，并将之安装在月球、“新天宫”太空城等地。2096年已经实际控制大半个火星的陈天云加入了战斗，并且陈天云手中的神秘新生力量可以利用各种力量修炼的武者在这场战斗中初展头脚。因其修炼的能量是极具攻击性的各式能量，所以战力惊人在力量层次仅仅相当于一阶变异者的武徒，虽然从表面上看和普通变异者差别不大，但其真正实力竟然可以直接匹敌二阶变异兽。因其在战场的极佳表现，顿时就在人类中引起了一场练武热。2097年第一支魔植太空军队组成，战斗的重心开始向太空转移。
自“雪神”事件之后人类与变异兽的战争开始向太空发展，从公元2091年至公元2100年双方在太空共进行了十三次总兵力在百万以上的大战，其余小规模战争不计其数。人类先后有三座太空城失陷，不过变异兽在数次攻城中均遭受了巨型武器的全面打击，变异兽群为此也付出了极其惨烈的代价。
公元2100年由人类各势力联合筹建的，第一支太空战舰部队在远离主战场的火星成立。这支仅仅只有一百艘太空战舰的军队，第一次出战就让人类彻底掌握了战争主动权。
公元2101年七月，由三百只三阶变异兽带领的六百万二阶变异兽大军，对“新天宫”这个拥有人口一千八百余万人的人类第一太空城发动了总攻。“新天宫”太空城对于人类来说极其重要，不仅仅是因为它是人类最大的太空城，还是因为它于月球的防御可以完美互补，只要“新天宫”不破那么变异兽就永远不要想真正的威胁到月球。所以“新天宫”仅常备军队就拥有陆军一百万、各级武者一万、战机一万架和近十万株由魔植组成的防护网，并且“新天宫”还拥有两台威力惊人的巨型武器。而且为了援助“新天宫”人魔联军还调集三十六万架战机、一百万魔植太空部队。并且把自建成就被雪藏的太空舰队，也派了过来作为这次战斗的底牌。