本来他是肩负着带领拜仁慕尼黑实现欧冠称王的目标的。
因为在那之前，拜仁慕尼黑在欧冠上的成绩算不上太好，虽然三年内两次杀入决赛，但一次在伯纳乌输给了穆里尼奥的国际米兰，一次在自家门口被切尔西的德罗巴给绝平了，最后点球大战中输掉了比赛。
距离欧冠就总是差那么一口气。
再加上联赛中也面临着多特蒙德的步步紧逼，十分狼狈。
拜仁慕尼黑俱乐部高层就萌生了换帅的念头。
当时执教球队的是功勋主帅海因克斯，不过年事已高，所以也应该考虑接班人的问题了。
但拜仁慕尼黑俱乐部的操作有些迷，在2012-2013赛季的半程，就突然宣布了新任主帅的人选，继任者正是瓜迪奥拉。而那个时候俱乐部和海因克斯的合同还没结束呢，就算瓜迪奥拉要上任，也得等到赛季打完。
当时不少媒体都批评拜仁慕尼黑俱乐部的这个做法，是非常严重的公关事故，是对老帅海因克斯的极度不尊重。
但也不知道是不是拜仁慕尼黑的这个迷之操作刺激了老帅海因克斯，也刺激了拜仁慕尼黑的球员。
宣布换帅消息之后，拜仁慕尼黑的表现突然变好，一路高歌猛进，杀进了欧冠决赛。
在联赛中他们从多特蒙德手中抢回了联赛冠军，在德国杯中，他们击败斯图加特捧起了奖杯。在欧冠决赛，他们击败了老对手多特蒙德，最终成就了德国足球历史上的首个三冠王！
拜仁慕尼黑高层让瓜迪奥拉来执教，是看重他在2008-2009赛季带领巴塞罗那获得三冠王的经验和能力，希望他能够在拜仁慕尼黑复制这样的成功经历。
哪想到在瓜迪奥拉即将上任之前，要被他换下去的海因克斯竟然做到了！
这就有点尴尬了……
当时就有媒体幸灾乐祸地表示这下瓜迪奥拉将面临着空前的压力。
是啊，他的前任珠玉在前，已经拿到了几乎一个俱乐部主帅所能拿到的所有最高荣誉，接下来他还怎么玩？
就算他拿到三冠王，可能也只会被认为是追平了海因克斯而已，除非他复制自己在巴塞罗那的六冠王伟业，否则恐怕都将一直活在海因克斯这位退休主帅的阴影中。
但合同都签了，这个时候瓜迪奥拉放弃执教拜仁慕尼黑显然也是不可能的。
就这样，头上顶着巨大的一团乌云，瓜迪奥拉在拜仁慕尼黑走马上任。
商人的第一个赛季，他率领拜仁慕尼黑在联赛中取得了巨大的成功，最终以超过第二名多特蒙德十九分的巨大分差夺冠。但其实他们夺冠的日子还要再提前一些，在三月份，联赛第二十七轮打完，瓜迪奥拉的球队就领先第二名多特蒙德二十五分，提前七轮夺冠。创造了欧洲五大联赛夺冠最早的纪录。而且瓜迪奥拉的球队在那个赛季还创造了十九连胜的纪录。
联赛中三月份就夺冠了，按理说他们有足够的时间来准备欧冠，争取在欧冠中取得很好的成绩。