朱震亨研習朱熹的學術思想，對於其後在醫學的建樹有著重要的影響。如朱熹關於精神與物質相互依存的觀點、強調清心寡欲以養身的觀點都被朱震亨運用到醫學之中，形成了新的醫學理論。
那麼朱震亨為什麼要從儒轉醫，有哪些因素促使他轉變的呢？首先是他素懷惠民之心，“吾既窮而在下，澤不能致運。其可遠者，非醫將安務乎？”另一方面，在他30多歲時，母親得了重病，請了許多大夫都束手無策。於是開始有了自己從醫的想法。他找來古代經典醫籍仔細讀了起來，這樣堅持了三年，收穫甚多。又過了兩年，竟然自己處方抓藥，治癒了老母的舊疾。
又因其師許謙本不以名利為務，教授學生“隨其材分”而定，“咸有所得”。又說：“吾臥病久，非精於醫者不能以起之。子聰明異常人，其肯遊藝於醫乎？”此言正中朱震亨下懷，於是他燒掉了以往所學的儒學之書，一心致力於醫。
雖然朱震亨自學已有些成就，但始終未遇到理想的老師。直到後來經人介紹認識了羅知悌，羅知悌人稱太無先生。他是金朝河間學派創始人劉完素弟子荊山浮屠的門徒，並旁通李東垣、張子和之學說，在醫學上有很深的造詣。朱震亨得之後說，不勝欣喜，立即到羅知悌的家，拜他為師，兩人一見如故。
羅知悌先生時已年過古稀，臥於床上，並不親自診視，只是讓弟子察脈觀色，但聽回稟便處方下藥。隨其學習一年之餘後，朱震亨醫技大進，盡得諸家學說之妙旨。回到家鄉，鄉間諸醫“始皆大驚”，不知他在外邊學了多大本事，但看其處方用藥，又嘲笑不已，以為不倫不類。但朱震亨正是用這種被眾醫斥之為離經叛道的方法治癒了許謙的痼疾。四方求治者、求學者盈門不絕。朱震亨總是有求必應，不避風雨，深得人們的愛戴。
朱震亨能躋身於元代四大名醫之列，除了他能繼承前人的理論和經驗，具有高超的醫術外，更重要的是他能在醫學理論上推陳出新，提出了許多新的學術見解，從而豐富和發展了傳統的醫學理論，對後世的醫學發展作出了重大的貢獻。其《格致餘論》一書，充分反映了他關於人身“相火”和“氣常有餘，血氣不足”的學術思想。
朱震亨在強調陰血的重要作用和保養陰血方面作出了開創性的貢獻，因而被後世稱為“養陰學派”的開山鼻祖。這一學術思想不僅豐富和發展了傳統的理論和治法，而且他所強調的養陰和瀉火二法，對於熱性病的治療尤其有重要的指導價值。在這一方面，他對明清時代溫病學派的崛起與養陰法的進一步完善，發揮了巨大的作用。