在北伐方面，孫中山認為中央政府成立，士氣百倍，和議無論如何，北伐斷不可懈。1月6日，北伐聯軍總部從上海移往南京。孫中山宣布自任北伐總指揮，任命黃興為陸軍總參謀長，同時制定了6路北伐的計劃，並通告副總統黎元洪執行。6路北伐軍是：以鄂、湘為第一軍，由京漢鐵道北進，粵皖為第二軍，向河南北進；與第一軍會於開封、鄭州間；淮陽為第三軍，煙臺為第四軍，向山東推進，會於灤州、秦皇島；合關外之兵為第5軍，山陝為第6軍，向北京進擊。一、二、三、四軍即達目的後，與第五、六軍直指敵。
袁世凱所依仗北洋6鎮，也就10萬人，因為清政府不得人心，兵源招募越加困難，北洋軍經不起消耗。而湖北一帶，鄂軍、湘軍、贛軍、粵軍等10餘萬，在兵力上遠遠超過段祺瑞。兩江地區，且不說楊洪森手下的10餘萬皖軍，光南京就集中了近四十萬的兵力。但是，6路北伐軍隊，只有兩路沿津浦線北上，煙臺、關外兩路有所行動外，其他兩路並無動作。
為了響應偉大的北伐號召，楊洪森向黎元洪請辭，黎元洪同意他走，但是部隊要留下來，楊洪森當然不能答應/他堂堂皖軍援鄂總司令光股屁回安徽，以後還怎麼北伐，怎麼參加革命。
黎元洪想把楊洪森的皖軍留在湖北收為己用，要知道楊洪森從湖北搶走了那麼多好東西，他怎麼付出些什麼吧。
楊洪森與黎元洪鬥智斗謀的時候，從安徽傳來了一個令人悲痛萬分的消息，安徽副都督兼水利部部長被人槍殺了。
在皖北治理淮河的吳春陽，並不安心於本職工作，他把在安慶的李虎部北調參與北伐，他聯絡了一幫子人把朱家寶給廢黜了，推柏文蔚做都督，又從江西借來了黃煥章部駐所在安慶。
黃煥章是個庸劣異常之人，他所部2000人是新近招募來的洪江會會徒，軍紀很壞。入皖之後黃煥章便向吳春陽索餉無果，便直接向安徽財政廳索餉，安徽財政廳斷然拒決。黃煥章大為不滿，趁著吳春陽去合肥之機，突然發動兵變，
先唆使軍士放槍威嚇，後指揮所部圍攻軍政府府，洗劫軍械庫、造幣廠、國庫以至商店和富戶。國庫銀洋300萬餘元，軍械庫步槍6000餘枝、子彈200餘萬發、馬克泌20挺、山炮30門被劫走，損失將近800萬元。
黃煥章便出布告稱安徽一切軍政由他負責，安慶挺進社會員更是遭到黃煥章大肆捕殺，城頭掛滿了人頭。
消息傳到合肥後，吳春陽南下安慶，來到黃煥章軍營要黃煥章將所掠奪的庫銀、軍械和商民財物如數歸還，至於軍費，可以保證籌給，黃煥章不理睬他。次日，吳春陽再次找黃煥章，被黃拘禁後槍殺。
楊洪森得知消息後趕緊竄到黎元洪的都督府。
吳春陽一死，蕪湖的王天培、貴池張四維最先起兵，接著合湖、太湖的皖軍全動了起來。
黃煥章知道自己捅了麻蜂窩後，根本不敢留在安徽，但是他又走不了，只好拉壯丁死守安慶城，可是誰又願意和他死守安慶。
馬毓寶派總參謀長李烈鈞來皖善後，李烈鈞來皖之時，黃煥章被部下押解出城，李烈鈞將黃煥章撤職看押，將黃煥章的謀士、肇事人顧英槍決，後又復令黃部士兵將所掠財物悉數交出，搬入軍政府，會同各方發還原主認領。
南京方面讓李烈鈞暫代安徽都督一職，李烈鈞才當了一天的安徽都督，楊洪森便從湖北趕了回來。
楊洪森臉色及其難看，帶傷的王亞樵被罵的頭都不敢抬，“被人家潯軍端了咱們皖軍的老窩連個屁都敢放，非要等老子回來你們才有定斷嗎？”