南、北軍事衝突爆發後，西方各國紛紛居中斡旋，其中日本最為賣力，英、法、美等國其次，北洋軍在信陽一帶損失兵力超過2萬人，許昌、洛陽、鄭州不斷遭到了南方空軍的打擊。段祺瑞也派了飛機南下支援，但南方空軍的數量和質量均超過北洋軍，使得河南的制空權完全掌握在了南軍手中。
為了配合陝西的靖國軍，空軍開闢了空中走廊，對陝西境內的重要軍事據點進行轟炸，同時向渭北的靖國軍提供有限地械餉支援。
陝西革命黨人發動數萬群眾在三原修建起一座臨時機廠。雖然六架飛機不足以改變陝西的戰局，卻能極大的鼓舞革命軍將士的士氣。
駐紮在安康的馮玉祥部通電全國拒打內戰，馮國璋等直系將領發現皖軍現在鳥槍換炮，比兩江那會不但能打，而且裝備更好，機槍和炮火優勢太過明顯，各一線部隊傷亡很大。
鑑於北軍的傷亡，段祺瑞遂請各國主持和談。
“中央方面將任免胡漢民為廣東都督，鍾斌為廣西都督，不知這樣是否滿意。”
“兩廣目前已在我黨控制中，如果想就和平達成一致，我方意見是北洋軍退出陝西，至於賠款給個300萬元就行了。”
“割地賠款，那有這樣的道理。”
“那咱們就別談，那就繼續打，看看是你們的杆子硬，還是我們的杆子硬。”
雙方都派出了以軍人為代表的談判團，雙方談著談都眼紅脖子，個個扯衣服，挽袖子。最後在日、英、美、法的協調下，雙方實現全面停火，陝西保持原來的態勢，兩廣交由南京留守政府，至於賠償則從海關厘金盈餘中扣除。南、北雙方分別在北京和南京簽訂了《停戰協議》，南征失敗對段祺瑞的影響不是很大。
南征雖然失敗了，但是意義重大，一方面南軍的真實實力被暴露了出來；另一方面直系被打殘廢了。
新的總統，新的內閣，馮國璋把段家的女性成員全操了一遍。
日本方擔心段祺瑞倒台會影響其在華利益，對於段政府請求提供軍援，思量再三者答應了下來。日本這次的軍援數量大、質量很高，北軍得到了大量75MM火炮，至於100+的重炮，日本口頭表示未來將幫助助建，至於未來是何時那就老天和日本人自己知道了。作為交換日本對滿、蒙進行了更為廣泛的滲透。
段祺瑞利用日本的軍援大肆擴充皖軍。
“丫的，這傢伙口口聲聲說北洋經費困難，娘的他這是要把老子給吃了。”馮國璋大罵著，一班將領更是憤憤不平，他們在前方拼死拼活，姓段的卻在他們後面捅刀子。
“大帥，你可要拿個注意，這樣下去，咱們手中的部隊都沒了。”