织田信长死后，其部将羽柴秀吉继承了织田的统一事业。秀吉出身尾张国的上层农民家庭，其父为织田亲兵，初称木下藤吉郎秀吉。秀吉参加织田的军队后因表现突出而成为重要将领，并在1573年改称羽柴秀吉，以期成为丹羽长秀、柴田胜家那样的织田家臣。本能寺之变后，秀吉与其对手毛利氏和好，然后率军回京都打败明智光秀，迫使其自杀，并以织田的后继者自居。1583年秀吉在近江打败柴田胜家，同时修建大阪城，作为自己统一全国的根据地。1584年秀吉与织田之子信雄、德川家康的联军发生战斗，未分胜负后讲和。1585年秀吉征服四国，天皇授其“关白”职务，1586年任太政大臣，并获天皇赐姓“丰臣”，以后称为丰臣秀吉。1587年秀吉南征九州，岛津义久投降。1590年秀吉出征关东地区，包围小田原城，迫使北条氏自杀，并使东北的伊达政宗臣服。1591年丰臣将“关白”之职让给养子秀次，自称“大閤”。1593年统治北海道南部的松前氏归顺，将北海道南部划入日本版图，至此统一大业终于完成。因秀吉晚年在京都伏山筑城居住，后该地因种植桃树而被称为桃山，因此，织田、秀吉时代也被称为“安土桃山”时代。
三、丰臣政权
丰臣秀吉在世时大权独握，因而中央政府组织并不完备。最初设“五奉行”，由五位的亲信分别掌管行政、司法、财政等事务。平时各司其职，如有重大事务则“五人合议，妥善裁决”。后来又任命德川家康等实力最强的六位大名为“大老”，即其中的一人死后称为“五大老”，共同商定重大事务。这种因人设位的做法隐含着危机，一旦丰臣去世，其平衡立即被打破。丰臣政权的经济基础主要是其直辖领地，另外控制了主要金银矿山的开采以及货币铸造，以及京都、大阪、堺等工商业城市的征税。
为巩固对全国的统治，丰臣秀吉政权采取了诸多严厉的措施。第一，在1588年颁布《刀狩令》，借口铸造京都方广寺大佛需要铁钉，收缴农民手中的武器。其真正目的是“贮藏武器，必使年贡杂赋滞纳，企谋暴动”，因而必须没收“诸国百姓所持刀、腰刀、弓、枪支等武器”；第二，实施“太閤检地”，即通过丈量全国的土地面积，确定土地耕种者以及年贡（即赋税）的承担者。在1591年全国检地完成后，命令各国大名提交帐册和地图，以总收获量即“石高”核定其提供军役的准确数量；第三，颁布《身份统制令》，规定武士、町人、百姓各守其业，实施兵农分离、农商分离政策。禁止农民流动，武士脱离农业居住在主君所在的城下町，并随主君移动；第四，统一度量衡，推动手工业、商业的发展。如废除行业垄断制度、减轻商人的赋税负担、撤消关卡、修建道路等。