張善安在洛陽被公開處死，李密王世充等人也被通知前去觀刑。看著張善安被處以千刀萬剮之刑，死的無比痛苦，李密這些曾經的反王，也不由的後背汗濕衣襟。他知道這是皇帝的警告，雖心裡苦澀，卻也無奈。
殺死張善安後，皇帝便下詔，各道諸郡，全面推進軍改、稅改，全面考核官員，能者上，弱者下。
此時朝廷名義上一統天下，除了江東、江西、湖南三道還未平定，其餘各地皆已掃平。
安東、遼寧、河北、定襄、朔方、河東、山東、河南、淮南、關中、隴右、河西、巴漢、湖北、劍南、雲南、黔中、廣東、廣西、廣南，實際統有二十道，劃為二百零八郡，縣一千零十五。
樞密院和兵部拿出的軍改方案是實行府兵制的同時，再增加了禁軍系統。
禁軍編設左右神策左右神威左右神武，和左右神機左右神捷左右神勇，共十二軍，每軍兩萬四，共計二十八萬八千人。
他們稱為北衙十二軍，負責拱衛六京，宿衛皇城，隨扈皇帝。十二軍主要駐於六京，同時也輪流到邊疆駐守，並且遇一般的戰事、叛亂，優先抽調禁軍出征。
除這北衙十二軍外，原府兵十二衛四府，依然保留，十二衛為左右驍衛、左右武衛、左右翊衛、左右屯衛、左右侯衛和左右御衛，十二衛統領南衙府兵，天下各道設立軍府，編額五十七萬六千，每衛編有四萬八千。
此外南衙還有四府，四府為金吾衛府、千牛衛府、備身衛府、監門衛府。此四府不統外府兵，只統皇帝近身侍衛以及宮門守衛。
另外還有內軍十二軍府，內軍則是親勛翊三衛六軍府，以及東宮親勛翊三衛六軍府，內軍皆由貴族勛戚官員子弟充當。
整個大秦軍隊體系很清晰明確，規模也十分龐大，達到百萬之眾。
其中南衙府兵是屬於戰時為兵閒時為農的農兵一體，而禁軍體系，則是募兵制下的常備軍職業兵體系。
主要是從府兵中精選的年輕精銳之兵，他們當兵拿餉，職業軍人。
至於南衙四府，則是府兵番上宿衛。
而內軍，則是勛戚官員子弟充當，這些人充當皇帝的侍衛同時，也相當於是武官培訓。
沒有全面繼承隋朝的府兵制，是因為大秦的國策是要不斷開疆拓土的，因此必須有常備軍，而不搞全面募兵制，則是因為全面募兵制軍費太高，大秦也吃不消。
所以北衙禁軍和南衙府兵，其實就相當於是兩級軍制，一般情況下，有北衙軍就夠了，若是戰事規模擴大，或者內部叛亂的情況下，則開始徵召府兵補充。
北衙軍由皇帝直接統領，而南衙軍由宰相負責。樞密院、兵部、十二衛、十二軍分別掌握軍令、軍政、統兵等職權。
一般情況下，大秦朝廷只需要供養北衙的十二軍以及南衙四府和內軍即可，軍費開支降低同時，秦軍的戰鬥力又能保持。