x教授坐在轮椅上，他脸上没有露出丝毫惊讶之色，作为跟万磁王相爱相杀几十年的人，x教授早在万磁王被抓起来时就知道，他是不会就这么安心地呆在监狱里的。
不过这次的结果还是让x教授有点意料不到，这次救出万磁王的人虽然没有露面，但是通过获得的情报来看，这些人拥有不少异能，其中有着操控天气(雾隐之术)操控空气(风切)的能力。
x教授也想不出万磁王手下什么时候多了这些强大的变种人的。
他对镭射眼道，“既然万磁王已经被救出去，那么我们在这讨论意义不大，现在我们要注意的还是白宫那边。”
x教授最近真的是被社会上露出的迹象愁坏了，变种人和人类之间的矛盾日益尖锐，这种人种间的矛盾是最难调和的，x教授也不敢保证，美国政府会怎么应对。
现在自己的老伙计马克思又出来了，他可是变种人的领袖，而且他一向敌视普通人，如果他再从中捣乱的话，那么变种人和人类之间的战争就在眼前!
金刚狼”罗根为了找回自己过去的记忆离开了X教授的学校，隐姓埋名前往艾卡里湖()工业中心;另一边，人类议会正忙于重建在变种人大战中受到重创的自由女神像。
本来如果万磁王呆在塑料监狱里的话，那么社会上将平静很多，可是坏事情就是接二连三地发生了。
就在x教授想着如何应对日益尖锐的种族矛盾时，一场针对美国总统的惊天刺杀行动中，具有瞬间移动和隐性能力的新类型变种人--蓝魔鬼的现身，不但再度引起政府和社会上对变种人的抵触情绪，更掀起了一场来势汹汹动机不纯的反变种人运动。
在白宫内，一向敌视变种人威廉·史崔克将军与参议员罗伯特·凯利，正与总统筹划展开针对变种人总部X学院的武力行动。而总统身边的助手，秘密化名安妮·瑞诺德斯的变种人--死亡女，也有着不为人知的秘密打算。
史崔克是谁，史崔克可是变种人特殊部队的创始人之一，二战之后，他就利用国家都名义，聚集变种人进行着实验，而金刚狼就是因为他，才得到由艾德曼金属制造的骨骼，而他的失忆也是因为史崔克。
他的儿子也是变种人，可是他却将他的儿子变成了实验材料，而且最后将其改造成了没有思想的兵器。
从这点就可以看出，史崔克对变种人的敌视之情有多深。
这次针对x学院，也是让他有了一丝嗜血的**，他对于变种人只有一种态度，那就是杀!
X教授这边，金刚狼在艾卡里湖的调查一无所获，只有先返回X学院助阵;而具有操纵火焰能力的新X战警火人登场，也令X战警们士气大振。
集合了力量的X教授希望通过自己的超能力，找到刺杀总统的新类型变种人蓝魔鬼。但是，蓝魔鬼的特殊能力使他散发出的变种人信号非常微弱，连X教授也无法找到他的确切位置，只能模糊地感觉到其人应该身处波士顿附近。