抗戰結束不久，原軍統總負責人因飛機失事死亡，他手底下的幾位得力幹將為了奪權爭得不可開交，而後邵瑜另闢蹊徑，親自去重慶面見果黨首領，接著詳述多年業績，並一再表達忠心，最終邵瑜靠著滬上站出色的業績，在一干人等中脫穎而出，接替了那位處座的位置，坐上了軍統總局的一把手。
抗戰結束後的果黨，主要精力不再是對付東瀛人，而是對付紅黨。
原本軍統對付東瀛間諜，中統抓捕地下黨，兩個機構雖然分工明確，但卻一直明爭暗鬥，而在抗戰中主要精力用來對付東瀛人，中統勢力因為戰爭大為受挫，而軍統卻逐漸發展壯大，等到內戰開啟，兩個機構的職責再次劃分，軍統管軍中，中統管黨內。
只是到底不會再像內戰之間那麼清晰，兩個機構指責很容易遇到重合的時候，每當這個時候，邵瑜總是表現得十分強勢，一度將中統打壓得抬不起頭來。
邵瑜多年前便成婚，但一直等到東瀛人離開華夏，也沒人見到他的妻子，難免也引起了一些懷疑，但邵瑜早就做好了準備，直接偽造了一份文書，造成了鄭錦繡帶著孩子死在海難里的假象，邵瑜為了做局成功，對待邵父邵母和鄭父鄭母都沒有說真話。
在原劇情里，東瀛人進入滬上，果黨撤離的時候，四個老人家全都不在撤離名單之上，但因為邵瑜加入軍統的緣故，幾乎所有軍統人員的家人全都跟著果黨一起撤離，因而四個老人家這一世雖然轉移時十分狼狽，但確實沒吃多少苦。
四個老人家因為失了鄭錦繡母子，還傷心難過了一陣，只是沒過多久便開始打著要給邵瑜娶新婦的主意，不僅邵家老兩口一直勸邵瑜再婚，就連鄭家老兩口也跟著勸說，邵瑜也怕上頭的人為了拉攏他會幫他說親，到時候恐怕就要背叛鄭錦繡同知，便上報組織請求給他派了一個女紅黨過來打掩護。
這掩護一打就是四年，那個女紅黨因為一直沒有生孩子的緣故倒是被人嘀咕了幾句，而後卻傳出來消息，不能生的不是邵瑜的續弦，而是邵瑜，這樣一波自爆之後，邵父邵母傷心了一陣，便轉而將所有的希望放在邵瑜的兩個女兒身上了。
軍統的勢力日漸壯大，邵瑜傳遞給組織的情報也越來越多，這些情報在戰場上全都化為紅黨軍人的利器，也不是沒人懷疑過軍統內部有問題，邵瑜面對這樣的質疑壓根沒有心虛，畢竟任懷疑誰都好，不會有人直接懷疑邵瑜這個頭目。
邵瑜借著排查軍統內部的名義，操作了一番，最終結果倒是把那些真正的軍統人給排查出去了。
整個軍統局在邵瑜的把控之下可謂是密不透風，內戰後期，整個軍統站里已經找不到幾個真正的軍統了，除了紅黨臥底就是邵瑜的親信。
而後內戰結束，全國解放，邵瑜也沒有留下來，而是順勢跟著轉移至寶島，兩年後，果黨首領在邵瑜精巧的殺局之下偽造成意外死亡，之後其子繼位之後，邵瑜帶著自己的人馬從果黨內部獨立了出來，多年積累，他在果黨內部有了一大批死忠，這些人隨著邵瑜成立了另外一隻黨派。