1943年3月，金海军上将明确了海军的编制，并为各舰队规定了战斗序列。凡在大西洋和地中海作战的美国舰队，一律授予偶数番号；凡在太平洋作战的美国舰队，一律授予奇数番号。
按此规定，将太平洋的几支主要海军部队分别编为：
1. 美国第5舰队为了适应作战需要，各舰队下辖特混舰队、特混大队和特混小队。例如，第31.2.3特混小队，是指第3舰队第31特混舰队第31.2特混大队中的一个特混小队。为了便于组织后勤工作，把需要有同类装卸设备的同型舰船编在一起，组成后勤大队或后勤中队。，即以珍珠港为基地的中太平洋部队。
2. 美国第3舰队，即哈尔西将军直接指挥的南太平洋部队(特纳将军指挥的两栖作战部队，称为第3两栖作战部队)。
3. 美国第7舰队，即在麦克阿瑟将军统辖下的一支规模不大的西南太平洋海军部队，由阿瑟·卡彭特海军中将指挥(后由金凯德海军中将继任)。下属的两栖作战舰艇和支援舰只编为第7两栖作战部队，由丹尼尔·巴比海军少将指挥。
第7舰队与第3舰队、第5舰队不同，它不隶属于太平洋舰队，因而不归尼米兹将军统辖。
收复阿图岛和基斯卡岛
在日军占领阿图岛和基斯卡岛后的一年左右时间，在阿留申群岛一带，盟军主要是使用飞机和潜艇对日占岛屿进行袭扰，使其陷于孤立无援的境地。但在1942年8月，美国的巡洋舰驱逐舰编队，曾经穿过浓雾，从海上对基斯卡岛进行一次炮击。在此后的几个月里，只要气象条件允许，加拿大和美国的陆军航空兵就去空袭这两个日占岛屿，对其进行袭扰。1942年至1943年冬，美军占领了阿达克岛和阿姆奇特卡岛(后者位于基斯卡岛东南约65英里处)。在这两个岛上，美军以前所未有的速度修建了机场。因此，美军进驻这两个机场的战斗机掩护轰炸机很快就切断了基斯卡岛和日本之间的海上运输线。
1943年2月中旬，美国查尔斯·麦克莫里斯海军少将，为了封锁阿留申群岛最西面的阿图岛，对该岛曾进行炮击，并派出巡洋舰驱逐舰编队在该岛西南海域进行巡逻，以破坏日军的海上补给线。在这次行动中，美军编队袭击了日军驶往阿图岛的护航运输队，击沉一艘装载弹药的运输船，并使2艘运输船逃回千岛群岛的日军基地幌筵。据细萱戍四郎海军中将判断，日军与阿留申群岛之间的海上补给线很快就会被切断。所以，他于3月初率领所属的整个舰队，掩护护航运输队开往阿图岛，卸完军需物资后又安全返回幌筵。3月下旬，细萱海军中将再次组织护航运输队开往阿图岛。但是这时，麦克莫里斯海军少将正率领一个编队(巡洋舰2艘、驱逐舰4艘)在苏联的科曼多尔群岛以南海域巡逻，严阵以待，准备截击日军。接着，美日两军就在这里发生一场战斗，称之为科曼多尔群岛海战。这是一次典型的水面舰艇部队之间的昼间战斗。