美军在夸贾林岛及其附近小岛共伤1177人，其中177人战死，1000人负伤。日军守备兵力中约有地面部队1200人和其它人员3200人。其中除125名朝鲜劳工和49名日本人被俘外，其余全被击毙。在这4天的作战过程中，舰队一直留守附近海面，准备随时进行支援。美军舰只除被日军岸炮击中几发炮弹外，没有受到其它损伤。
斯普鲁恩斯认为，夸贾林岛的作战已不必动用上万人的军预备队，因而决定不失时机地夺取埃尼威托克环礁。他打算在这里再建一个后勤基地，以便为继续西进的越岛作战提供支援。但是，埃尼威托克环礁是马绍尔群岛西部的最大环礁，位置比较暴露。距马里亚纳群岛仅1000海里，离特鲁克岛不到700海里，至波纳佩环礁不到600海里。为使日军不能阻止美军进攻埃尼威托克环礁，必须把日军的上述基地封锁起来。或许有人认为，在夸贾林环礁的作战尚未完全结束之前就去进攻埃尼威托克环礁是难能为力的，也是非常冒险的。然而，尼米兹却毫不犹豫地表示同意，并命令有关方面为实施这一新的攻势提供一切必要的支援。
当日本大本营不得不承认俾斯麦群岛、吉尔伯特群岛和马绍尔群岛已经无法守住时，则将其防线大幅度后撤，撤到北起马里亚纳群岛、经由帛琉群岛南至新几内亚岛西部一线。日军为了赢得时间，重建其消耗殆尽的航空兵，则赋予这条新防线以东的各岛守备部队一个自杀性的使命，即削弱美军，迟滞其行动。夸贾林环礁失守后，联合舰队司令长官古贺认为，特鲁克岛已完全暴露在美军的攻势之下，便小心地将联合舰队的大部分兵力撤到帛琉群岛，在特鲁克地区仅留下2艘轻巡洋舰和8艘驱逐舰，以便保护当地的海军部队和基地的货船。
在此期间，日本正在本土加紧培训飞行员。岸基飞机的飞行员一经掌握飞行技术，就驾机沿着新防线南下，进驻加罗林群岛的特鲁克等前进基地。日军企图使用这种办法，沿着这条新防线着手建立一支能击败任何入侵之敌的军事力量。到1944年2月中旬，特鲁克岛上已配置飞机365架，还有200架飞机随时可从日本飞往马里亚纳群岛。