后来，这艘侦察潜艇遭到一架飞机的轰炸，最后在岛的东海岸上搁浅了。
艇长是一个名叫坂牧的海军中尉，被俘后，从他身上搜出了那张标着美国军舰位置的地图。另一艘“袖珍潜艇”，不知是由于操纵秩失误还是由于不能坚持潜航，于8 时35分浮现在港口的水面上，正好在“柯蒂斯号”飞机加油舰前面。刹时间，几艘军舰一起开火，接着，“莫纳汉号”驱逐舰就迎头冲擅过去，“袖珍潜艇”当即沉没了。后来，这艘小潜艇被打捞上来，运到美国，成为海军在战争期间举办的展览中的新鲜玩艺儿。一艘小潜艇竟然吸引了那么多的美国观众，这在世界上也是绝无仅有的。
日本在袭击珍珠港的战斗中使用了五艘这种袖珍潜艇，全部报销。
金海军上将曾写道：“虽然有几艘四十五吨的潜水艇参战，但是，这次袭击仍然是以空袭为主”。三百六十一架飞机从航空母舰起飞，分成三个梯队袭击珍珠港。研究珍珠港事件的历史学家们不谋而合，几乎一致把空袭过程分为如下几个阶段：第一步是从7 时55分到8 时25分，由鱼雷飞机、俯冲轰炸机出击。从8 时25分到8 时40分，“除个别飞机继续进攻外，保持暂时平静”。第二梯队的任务是高空轰炸，自8 时40分开始，至9 时15分止。紧跟着就是第三梯队的进攻，由俯冲轰炸机冲到硝烟中投弹，一直炸到9 时45分。轰炸持续时间是1 小时又50分。
最有效的攻击是由鱼雷飞机进行的。这些飞机使用的是带稳定装置的特种鱼雷，适用于水位浅（十三到十五米深）的珍珠港。美国人曾认为，由于珍珠港水位浅，可以排除人用鱼雷飞机攻击的可能性。然而，袭击一开始，几乎相当于驻太平洋战列舰舰队全部兵力的八艘美国装甲舰（只有“科罗拉多号装甲舰当时正在美国修理）在5 分钟之内全部丧失了战斗力。
唐纳德·W ·米切尔在《美国现代海军史》一书中写道：“任何一个活着的美国人都永远不会忘记12月7 日这天的下午。虽然战争是意料之中的事，但是这个开端却是当头一棒。可能任何国家都没有遭受过这样的打击。公众舆论顿时哗然，要求追究责任。不久，太平洋舰队总司令赫斯本德·E ·金梅尔海军上将、夏威夷群岛驻军司令肖特上将等好几个军事头目都被罢了官。