南線陶繼光與王振武等將領作為第二支北伐軍進駐南昌城，楊洪森隨即任命陶繼光擔任江西省長，方振武擔任江西軍政部長。工作重點要放在恢復江西工農業生產、穩定社會、治安，發展縣一級黨支部，鞏固江西根據地，保衛勝利成果。為此，軍事任務暫時退居次要位置。
李純經過一系列苦戰，在左右夾擊、前堵後追之下終於到達了九江城下，在海軍的全力支援下，迫使守軍撤出九江。隨李純從南昌殺出來的3萬大軍，此時只剩下不足8000人，皖軍主力正在陸續匯集中，九江城外操著各式武器從四面八方趕來的援軍有3、4萬之眾。至12月8日，北洋軍在江西只剩下了九江這一處橋頭堡。除了九江城內的北洋軍以及“撤入”湖南的部隊，北洋政府這十數天的時間裡損兵近4萬人。
12月10日，方文遠按照楊洪森的指示精神，發動對江西北洋軍的最後一擊。
遭到“化學彈”攻擊的北洋軍亂成一片，主將李純因吸入“毒氣”昏迷不醒，北洋軍指揮系統崩潰，眾兵將出城後擁擠在商埠外的碼頭處，李純本人在眾衛士的保護上船後安全撤至勞家渡，後轉至租界接受西式治療。
“化學彈”的效果讓袁世凱大為震驚，九江城內的守軍有半數因為吸入有毒氣體死亡或失去戰鬥能力。
袁世凱急忙向各國提出請求，向他們購買“化學”炮彈。
“化學彈”這種非常規武器，各國可能有，但不會放在貨架上，更不會大聲的叫賣。上海的各國軍火商再怎麼了不得也還是常規武器供應商。他們回答沒有，袁世凱來說就是拒絕向其出售。但是，ｗωｗ奇Qisuu書com網某些軍火商私下答應願為北洋政府提共有毒化學品方便其自行加工。
西方各國對江西戰事逆轉大為不安，以英、法為首的西方各國敦促南北和談。英國方面更是應北洋政府請求，派出艦隊進入長江，公開阻止南軍渡江進入湖北。為此，楊洪森派代表向英國方面表示抗議。
“如果英國艦隻阻撓、攻擊起義軍，軍政府將不得不啟動應急措施。”
英國方面並不是鐵了心的要幫袁世凱，只是通過武力威懾，嚇嚇楊洪森，看到楊洪森強硬的態度後，他們的態度隨即轉變。
“英國艦隊進入長江，只在保護各國在湖北僑民安全。”
英國公使在北京呼籲南北雙方進行談判，雷曼再次造訪安徽，這次他帶來了袁世凱的誠意。